La patogenia de la gangrena de Fourniere suele deberse a un pequeño foco infeccioso localizado que desborda la respuesta inflamatoria e inmunitaria local. En consecuencia, los organismos virulentos se aíslan con mayor frecuencia en presencia de alguna forma de inmunocompromiso. Por lo general, la infección es polimicrobiana y afecta a:
Se cree que existe una sinergia entre los organismos infectantes, por ejemplo, un organismo produce enzimas para trombosar los vasos cutáneos perforantes, mientras que otro produce enzimas para romper la fascia. En consecuencia, la necrosis de la fascia se propaga por debajo de la piel con el consiguiente infarto cutáneo y necrosis muscular tardía.
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